يُعنى معهد الضباط بتنفيذ البرامج العلمية والتطبيقية لضباط الشرطة في مختلف مجالات العمل الشرطي.

يُعنى معهد الرتب الأخرى بتأهيل منتسبي الشرطة من ضباط الصف ورفع كفاءتهم في مجال المهارات والمعارف الوظيفية وفق متطلبات الأداء الوظيفي والمهني.

يُعنى معهد الشرطة المستجدين بتدريب وتأهيل الشرطة المستجدين علميًا وعمليًا للعمل كأفراد في الشرطة.

يُعنى معهد الشرطة النسائية بتدريب وتأهيل الشرطة النسائية علمياً وعملياً للعمل كأفراد في الشرطة.

تُعنى إدارة ضمان الجودة والاعتمادي الأكاديمي بمراقبة جودة العملية التعليمية والتدريبية في الأكاديمية، بما يحقق رؤية الأكاديمية ورسالتها وأهدافها، كما تعمل على تلبية متطلبات الاعتماد الأكاديمي للبرامج التي تنفذ في الأكاديمية ومتابعة ذلك.

تُعنى إدارة أمن الاكاديمية بالمحافظة على الأمن والسلامة في حرم الأكاديمية وتفعيل وتطبيق خطط الطوارئ وإجراء التمارين للتأكد من الجاهزية، وتأمين المنشآت الحيوية، ومراقبة حركة الدخول والخروج من الأكاديمية مع فرض الضبط المروري، كما تعمل الإدارة على تنظيم الاتصالات الهاتفية الواردة إلى الأكاديمية والتنسيق مع إدارات الأكاديمية في حالة طلب المشاركة في مختلف المناسبات والفعاليات والطوابير التي تقام خارج الأكاديمية.

تعنى الإدارة بالتمارين العملية وإعداد السيناريوهات لمختلف المواقف التدريبية التي تتضمنها المناهج الدراسية للمتدربين، كمهارات الاتصال، والتحقيق الجنائي، ومسرح الجريمة، والمهارات العملياتية، وعمليات المرور والدفاع المدني والإسعاف.

تُعنى إدارة الشؤون الإدارية والمالية بتسيير الأمور الإدارية والمالية بالأكاديمية لضمان أفضل السبل لإنجاز العمل الإداري، وحفظ الوثائق والمستندات والمراسلات المتعلقة بالموارد البشرية وتنظيم الشؤون المالية، والإشراف على أقسام الشؤون الإدارية والمالية في إدارات الأكاديمية.

يُعنى مركز البحوث والدراسات بالبحوث والدراسات الاستراتيجية في المجال الأمني، وتشجيع التطوير والابتكار، وتوفير المراجع والمصادر التعليمية اللازمة للباحثين والمحاضرين والمتدربين، وتقديم الدعم للعملية التعليمية لمواكبة المتطلبات الحديثة.

يُعنى بـتـنـفـيـــذ خطـة العــلاقات العامة والتوجيه المعنوي الهادفة إلى رفـع الروح المعنوية لمرتب الأكاديمية والمتدربين، وتـنـمـية الولاء والشعور الوطني لديهم والانتماء للجهاز بالتنسيق مع إدارة العلاقات العامة بشرطة عمان السلطانية، كذلك يـضطلع القسـم بمهمة اتخاذ الـترتـيـبات الـخاصة بالاحـتـفـالات والـمناسـبات في الأكاديـمـية وتنظيم برامجهـا، والاسـتـعـانة بأجهزة ووسائل الإعلام لـتـغـطـيتها، واستقبال ضيوف الأكاديـمـية وزوارها، وإجراء الترتيبات اللازمة للإقامة والإعاشة والمرافقة، كـما يقوم قسم العلاقات العامة بتوثيق جـمـيع المـنـاسـبات الـتي تـقام في الأكاديمية، ويعمل القسم على متابعة المجلات والنشرات الصادرة عن الأكاديمية وضمان إصدارها في الأوقات المحددة.

تُعنى مدرسة موسيقى الشرطة بتدريب منتسبي شرطة عمان السلطانية على الآلات الموسيقية والمعزوفات العسكرية المختلفة، وتتولى أكاديمية السلطان قابوس لعلوم الشرطة الإشراف الإداري والمالي عليها، ويعود إلى إدارة موسيقى الشرطة الإشراف الفني وفقاً للائحة الإشراف الإداري والفني الصادرة بقرار المفتش العام للشرطة والجمارك رقم (20/94).